實驗室通風柜不是一臺單獨的設備，外部環境的變化會影響通風柜的性能。同時，實驗室通風柜以及其控制系統也會影響他周圍的，當您在選擇通風柜時：
先要考慮到整個系統的因素，例如：實驗室的空間、建筑物的通風控制系統、排氣管路的安排及通風柜的擺放等等。
其次，您需要確認您所需要的是哪一類型的通風柜，在選擇時，通常您可以按照以下因素來衡量：
一、通風柜上柜部分
1、有三種樣式：標準式、臺式、落地式。
2、通風柜的表面風速是否達到規定的風速要求：0.5m/s，
實驗室通風柜的開口高是否符合您對操作空間的要求，通風控制系統：定風量、變風量還是自適應性控制系統， 內襯板材質：抗貝特板、環氧樹脂板， 調節門的原料是否采用安全玻璃，其設計是否符合人體力學，使操作者拉動自如。
二、通風柜下柜部分
1、材質是否好用，是否為防火材料，是否可以減少實驗室的酸堿環境對他的侵蝕，電源供給是否合理， 是否便于維修水、電、氣系統 。
2、底柜是否需要抽氣設計，以便您放置揮發性的藥品 。
當您基本選擇好了通風柜的型號、樣式和尺寸之后，可以根據以下條件來定您所需要的附屬配件：
1、水來源： 蒸餾水、純水或是逆滲透水等等。
2、氣來源：氮氣、氧氣或是空氣等等。
3、電氣系統的選擇則要考慮：型號、電壓大小、防爆性等等。
三、臺面部分
臺面是否采用了碟狀設計，從而方便用戶清潔臺面和不讓毒性液體的外漏。臺面的材質是否符合您實驗的需求減少相應的分外浸蝕和高溫，是否安裝了杯槽和水槽，且安裝的位置是否合理，出風口的設計是否合理。
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